Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

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- w -

• w0_ : PLMD::isdb::Rescale
• wait() : PLMD::Atoms, PLMD::Communicator::Request
• waitData() : PLMD::PlumedMain
• walker_rank_ : PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• walkers_mpi_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• warning() : PLMD::Action
• wascleared : PLMD::vesselbase::AveragingVessel
• wasForced() : PLMD::gridtools::GridVessel
• wasforced : PLMD::gridtools::GridVessel
• wasreset() : PLMD::vesselbase::AveragingVessel
• watch : PLMD::Stopwatch::Handler
• watches : PLMD::Stopwatch
• WATERS : PLMD::membranefusion::fusionPoreExpansionP, PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP
• wave : PLMD::molfile::molfile_qm_timestep_t
• wave_coeffs : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• wavef_size : PLMD::molfile::molfile_qm_metadata_t, PLMD::molfile::molfile_qm_timestep_metadata
• waveletGrid_ : PLMD::ves::BF_Wavelets
• wavenumbers : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• weight : PLMD::colvar::ContactMap, PLMD::logmfd::LogMFD
• weight_mass : PLMD::vatom::Center
• weight_vals : PLMD::analysis::ReadAnalysisFrames
• weightHasDerivatives : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel, PLMD::vesselbase::StoreDataVessel
• weights : PLMD::analysis::ReadAnalysisFrames, PLMD::analysis::ReadDissimilarityMatrix, PLMD::dimred::SketchMapRead, PLMD::function::annfunc::ANN, PLMD::generic::FitToTemplate, PLMD::gridtools::ActionWithGrid, PLMD::mapping::Mapping, PLMD::MultiDomainRMSD, PLMD::ReferenceArguments, PLMD::vatom::Center, PLMD::vesselbase::ActionWithAveraging
• weights_ : PLMD::ves::TD_ExponentiallyModifiedGaussian, PLMD::ves::TD_Gaussian, PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal, PLMD::ves::TD_LinearCombination, PLMD::ves::TD_VonMises
• weights_calculated : PLMD::analysis::ReadAnalysisFrames
• weightsCalculated : PLMD::bias::ReweightWham
• weightWithDerivatives() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• welltemp_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• WellTemperedModifer() : PLMD::ves::WellTemperedModifer
• wfile : PLMD::analysis::ReadDissimilarityMatrix
• wgridstride_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• wham_pointer : PLMD::analysis::ReadAnalysisFrames
• WhamHistogram() : PLMD::analysis::WhamHistogram
• WhamWeights() : PLMD::analysis::WhamWeights
• what() : PLMD::Exception, PLMD::lepton::Exception, plumed_error
• what_buffer : plumed_error
• which_cluster : PLMD::adjmat::ClusteringBase, PLMD::adjmat::OutputCluster
• Whitespace : PLMD::lepton::ParseToken
• WholeMolecules() : PLMD::generic::WholeMolecules
• width : PLMD::drr::UIestimator::n_matrix, PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T >, PLMD::drr::UIestimator::UIestimator, PLMD::HistogramBead, PLMD::KernelFunctions
• work : PLMD::bias::MaxEnt, PLMD::bias::MovingRestraint, PLMD::logmfd::LogMFD, PLMD::PlumedMain
• work_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >, PLMD::ves::VesDeltaF
• workspace : PLMD::lepton::CompiledExpression
• WrapAround() : PLMD::generic::WrapAround
• write_1D_pmf() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• write_angles : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• write_bonds : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• write_files() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• write_final_positions() : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_model_overlap() : PLMD::isdb::EMMI
• write_positions() : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_positions_first : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_statistics() : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_statistics_first : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_statistics_fp : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_statistics_fp_deleter : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_statistics_last_time_reopened : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_stride_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• write_structure : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• write_timestep : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• write_volumetric_data : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• writeBasisFunctionsToFile() : PLMD::ves::BasisFunctions
• writeBiasGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeBiasOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeBiasToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeBiasWithoutCutoffGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeBinary() : PLMD::Atoms
• writeCoeffsInfoToFile() : PLMD::ves::CoeffsBase
• writeCubeFile() : PLMD::GridBase
• writeDataDiagonalToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• writeDataFullToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• writeDataToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• writeFesGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeFesOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeFesProjGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeFesProjOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeFesProjToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeFesToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeGaussian() : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• writehead() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• writeHeader() : PLMD::GridBase
• writeHeaderToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• writeIterationCounterAndTimeToFile() : PLMD::ves::CoeffsBase
• WriteLagrangians() : PLMD::bias::MaxEnt
• writeLogTargetDistGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeMatrixInfoToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• writeOutObservable() : PLMD::fisst::FISST
• writeOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeOutRestart() : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
• WriteStateFull() : PLMD::Random
• writeStatus() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• writeTargetDistGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeTargetDistOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeTargetDistProjGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeTargetDistProjOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeTargetDistProjToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeTargetDistributionToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeTargetDistToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeTimeInfoToFile() : PLMD::ves::CoeffsBase
• writeToFile() : PLMD::Grid, PLMD::GridBase, PLMD::SparseGrid, PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• written : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• written_1D : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• wStateStride_ : PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• wstride : PLMD::mapping::AdaptivePath
• wsum : PLMD::mapping::AdaptivePath
• wsum_ : PLMD::eds::EDS
• ww : PLMD::analysis::Histogram