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Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:
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N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
- p -
p :
PLMD::F1dim< FCLASS >
,
PLMD::generic::Plumed
,
PLMD::MDAtomsTyped< T >
,
plumed
,
plumed_function_holder
P0_contribution_ :
PLMD::opes::ECVcustom
,
PLMD::opes::ECVumbrellasFile
,
PLMD::opes::ECVumbrellasLine
pace_ :
PLMD::bias::MaxEnt
paction :
PLMD::FlexibleBin
pair_ :
PLMD::generic::WrapAround
pairs :
PLMD::ERMSD
parallelread :
PLMD::function::FilesHandler
,
PLMD::function::FuncSumHills
parameter :
PLMD::colvar::EEFSolv
parameters :
PLMD::function::Combine
,
PLMD::function::Stats
,
PLMD::isdb::Metainference
,
PLMD::isdb::MetainferenceBase
,
PLMD::vesselbase::VesselOptions
params_ :
PLMD::maze::Loss
parent_to_child :
PLMD::Subprocess
pars_da :
PLMD::isdb::CS2BackboneDB
partialTaskList :
PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
partition_estimate_ :
PLMD::fisst::FISST
partner :
PLMD::GREX
passMap :
PLMD::PlumedMain
past_increment2_ :
PLMD::ves::VesDeltaF
path :
PLMD::FileBase
path_cv_values :
PLMD::function::FuncPathGeneral
pathfile :
PLMD::mapping::AdaptivePath
PatternFlag :
PLMD::ExchangePatterns
pbc :
PLMD::ActionAtomistic
,
PLMD::Atoms
,
PLMD::colvar::Angle
,
PLMD::colvar::ContactMap
,
PLMD::colvar::CoordinationBase
,
PLMD::colvar::Distance
,
PLMD::colvar::EEFSolv
,
PLMD::colvar::ERMSD
,
PLMD::colvar::Position
,
PLMD::colvar::ProjectionOnAxis
,
PLMD::colvar::Template
,
PLMD::colvar::Torsion
,
PLMD::funnel::FUNNEL_PS
,
PLMD::gridtools::GridVessel
,
PLMD::isdb::CS2Backbone
,
PLMD::isdb::FretEfficiency
,
PLMD::isdb::JCoupling
,
PLMD::isdb::NOE
,
PLMD::isdb::PRE
,
PLMD::isdb::RDC
,
PLMD::isdb::SAXS
,
PLMD::mapping::PathReparameterization
,
PLMD::pamm::PammObject
,
PLMD::piv::PIV
pbc_ :
PLMD::colvar::DRMSD
,
PLMD::GridBase
,
PLMD::isdb::EMMI
,
PLMD::maze::Optimizer
,
PLMD::NeighborList
,
PLMD::s2cm::S2ContactModel
pbc_fwd :
PLMD::ActionAtomistic
,
PLMD::Atoms
pbc_param :
PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
pbox :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
pca :
PLMD::ReferenceValuePack
pca_names :
PLMD::colvar::PCARMSD
pdb :
PLMD::funnel::FUNNEL_PS
,
PLMD::GenericMolInfo
pdb_fwd :
PLMD::GenericMolInfo
pdbv :
PLMD::colvar::PathMSDBase
,
PLMD::colvar::PCARMSD
pDdStep :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
pdisplacements :
PLMD::mapping::AdaptivePath
period_ :
PLMD::fisst::FISST
periodic_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
,
PLMD::ves::TD_Grid
periodicity :
PLMD::HistogramBead
,
PLMD::Value
periods_ :
PLMD::ves::TD_VonMises
perp :
PLMD::multicolvar::VolumeCavity
,
PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
perp_dirs :
PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
pf_n_ :
PLMD::bias::PBMetaD
pfbox :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
pfhold_ :
PLMD::bias::PBMetaD
pForces :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
pfs_ :
PLMD::bias::PBMetaD
pGatindex :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
phases :
PLMD::vatom::Center
phivs :
PLMD::logmfd::LogMFD
physical_time :
PLMD::molfile::molfile_timestep_t
pid :
PLMD::Subprocess
pilots :
PLMD::PlumedMain
plumed :
PLMD::Action
,
PLMD::ActionOptions
,
PLMD::ActionSet
,
PLMD::Atoms
,
PLMD::DataFetchingObject
,
PLMD::FileBase
plumedDat :
PLMD::PlumedMain
plumedMain :
PLMD::GREX
pNLocalAtoms :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
pntrToECVsClass_ :
PLMD::opes::OPESexpanded
pointer :
PLMD::Communicator::ConstData
,
PLMD::Communicator::Data
points :
PLMD::function::Piecewise
,
PLMD::funnel::FUNNEL_PS
pos :
PLMD::molfile::md_atom
,
PLMD::molfile::md_ts
,
PLMD::multicolvar::VolumeInEnvelope
pos1 :
PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
pos2 :
PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
position :
PLMD::isdb::CS2Backbone::RingInfo
positions :
PLMD::ActionAtomistic
,
PLMD::analysis::DataCollectionObject
,
PLMD::Atoms
,
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
,
PLMD::generic::Plumed
,
PLMD::PDB
,
PLMD::RMSDCoreData
positions_center :
PLMD::RMSD
positions_center_is_calculated :
PLMD::RMSD
positions_center_is_removed :
PLMD::RMSD
positionsHaveBeenSet :
PLMD::Atoms
positionsToBeReceived :
PLMD::Atoms::DomainDecomposition
positionsToBeSent :
PLMD::Atoms::DomainDecomposition
potential_expansion_pntr :
PLMD::ves::MD_LinearExpansionPES
power :
PLMD::function::Ensemble
powers :
PLMD::function::Combine
,
PLMD::vesselbase::Moments
POXYGENS :
PLMD::membranefusion::fusionPoreExpansionP
,
PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP
pPositions :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
pre_fact_ :
PLMD::isdb::EMMI
prec :
PLMD::molfile::md_file
prefactor_a_ :
PLMD::s2cm::S2ContactModel
preps :
PLMD::analysis::OutputColvarFile
,
PLMD::gridtools::GridPrintingBase
pres0_ :
PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
pres_ :
PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
pres_low_ :
PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
pres_size :
PLMD::molfile::trx_hdr
,
PLMD::xdrfile::t_trnheader
press_ :
PLMD::bias::ReweightTemperaturePressure
,
PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
pretty :
PLMD::Exception::Location
prev_exp_alpha_ :
PLMD::ves::VesDeltaF
prev_pos :
PLMD::piv::PIV::SharedData
prev_stp :
PLMD::piv::PIV::SharedData
previous_fields :
PLMD::OFile
print_charges :
PLMD::generic::DumpMassCharge
print_debug_info_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
print_masses :
PLMD::generic::DumpMassCharge
print_stride_ :
PLMD::opes::OPESexpanded
,
PLMD::ves::VesDeltaF
printFirstStep :
PLMD::bias::MaxEnt
printStride :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
prior_ :
PLMD::isdb::EMMI
prob_ :
PLMD::ves::VesDeltaF
probability_decreaser_ :
PLMD::maze::Simulated_Annealing
proj :
PLMD::function::FuncSumHills
projdir :
PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
projection_args_ :
PLMD::ves::VesBias
projections :
PLMD::dimred::DimensionalityReductionBase
property :
PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath
,
PLMD::dimred::SketchMapRead
,
PLMD::mapping::Mapping
pseudo_virial_ :
PLMD::eds::EDS
pseudo_virial_sum_ :
PLMD::eds::EDS
pt :
PLMD::F1dim< FCLASS >
ptr :
PLMD::lepton::AsmJitRuntimePtr
,
PLMD::PlumedMain::plumed_error_handler
,
PLMD::TypesafePtr
,
plumed_nothrow_handler
,
plumed_nothrow_handler_x
,
plumed_safeptr
,
plumed_safeptr_x
pulling_ :
PLMD::maze::Steered_MD
pval :
PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
pweights :
PLMD::dimred::SketchMapBase
px :
PLMD::MDAtomsTyped< T >
py :
PLMD::MDAtomsTyped< T >
pythonCmd :
PLMD::GenericMolInfo
pz :
PLMD::MDAtomsTyped< T >
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