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Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
- i -
i :
PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row
,
PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
IA :
PLMD::Random
iclose1 :
PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
iclose2 :
PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
identical_coeffs_shape_ :
PLMD::ves::Optimizer
idum :
PLMD::Random
ifile :
PLMD::bias::MaxEnt
,
PLMD::generic::Read
ifile_ptr :
PLMD::generic::Read
ifiles :
PLMD::function::FilesHandler
ifiles_ :
PLMD::bias::MetaD
,
PLMD::bias::PBMetaD
ifilesnames :
PLMD::bias::MaxEnt
ifilesnames_ :
PLMD::bias::MetaD
,
PLMD::bias::PBMetaD
ignore_forces :
PLMD::generic::Read
ignore_time :
PLMD::generic::Read
ignoreFields :
PLMD::IFile
igolden :
PLMD::gridtools::GridVessel
IM :
PLMD::Random
imag_modes :
PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
imgVec :
PLMD::colvar::PathMSDBase
in :
PLMD::CLToolMain
in_apply :
PLMD::analysis::Histogram
in_restart_ :
PLMD::eds::EDS
,
PLMD::fisst::FISST
in_restart_name_ :
PLMD::eds::EDS
,
PLMD::fisst::FISST
incPrec :
PLMD::Random
index :
PLMD::ActionWithVirtualAtom
,
PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath
,
PLMD::generic::Plumed
,
PLMD::vatom::ActionWithVirtualAtom
index_ :
PLMD::AtomNumber
index_k_ :
PLMD::opes::OPESexpanded
indexCnt :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
indexDsp :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
indexes :
PLMD::ActionAtomistic
indexmap :
PLMD::function::FuncPathMSD
indexOfTaskInFullList :
PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
indexR :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
indexS :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
indexToBeReceived :
PLMD::Atoms::DomainDecomposition
indexToBeSent :
PLMD::Atoms::DomainDecomposition
indexvec :
PLMD::colvar::PathMSDBase
indices :
PLMD::analysis::DataCollectionObject
,
PLMD::multicolvar::AtomValuePack
,
PLMD::multicolvar::CatomPack
,
PLMD::MultiValue
,
PLMD::ReferenceAtoms
indices_shape_ :
PLMD::ves::CoeffsBase
inept :
PLMD::isdb::PRE
info :
PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
ingrid :
PLMD::gridtools::ActionWithInputGrid
,
PLMD::gridtools::GridPrintingBase
init :
PLMD::HistogramBead
,
PLMD::SwitchingFunction
,
PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
init_stp :
PLMD::piv::PIV::SharedData
initial_weight_dist_ :
PLMD::fisst::FISST
initial_weight_rate_ :
PLMD::fisst::FISST
initialBias :
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
initialized :
PLMD::GREX
,
PLMD::PlumedMain
initstride :
PLMD::function::FuncSumHills
inMiddleOfField :
PLMD::IFile
input_count :
PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
input_filename :
PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
input_grad :
PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
input_of_each_layer :
PLMD::function::annfunc::ANN
inputData :
PLMD::CLTool
,
PLMD::cltools::CLTool
inputdata :
PLMD::CLTool
,
PLMD::cltools::CLTool
inputForce :
PLMD::Value
insertion :
PLMD::molfile::molfile_atom_t
inst_alpha_ :
PLMD::ves::VesDeltaF
integratehills :
PLMD::function::FuncSumHills
integratehisto :
PLMD::function::FuncSumHills
intensities :
PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
intercomm :
PLMD::cltools::GenExample
,
PLMD::generic::Plumed
,
PLMD::GREX
intercomm_fwd :
PLMD::GREX
interval :
PLMD::logmfd::LogMFD
interval_bounded_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_intrinsic_max_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_intrinsic_max_str_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_intrinsic_mean_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_intrinsic_min_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_intrinsic_min_str_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_intrinsic_range_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_max_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_max_str_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_mean_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_min_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_min_str_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
interval_range_ :
PLMD::ves::BasisFunctions
inthessian :
PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
intracomm :
PLMD::cltools::GenExample
,
PLMD::GREX
intracomm_fwd :
PLMD::GREX
intValue :
PLMD::lepton::Operation::PowerConstant
inum :
PLMD::vesselbase::BridgeVessel
inv_cov_md_ :
PLMD::isdb::EMMI
inv_gamma_ :
PLMD::ves::VesDeltaF
inv_max_minus_min :
PLMD::HistogramBead
,
PLMD::Value
inv_normfactor_ :
PLMD::ves::BF_CubicBsplines
,
PLMD::ves::BF_Powers
inv_r_eff_ :
PLMD::s2cm::S2ContactModel
inv_sigma_ :
PLMD::ves::BF_Gaussians
inv_spacing_ :
PLMD::ves::BF_CubicBsplines
inv_sqrt2_ :
PLMD::isdb::EMMI
invalidateList :
PLMD::colvar::CoordinationBase
,
PLMD::s2cm::S2ContactModel
invbeta :
PLMD::BiasWeight
,
PLMD::ProbWeight
,
PLMD::ves::FesWeight
invbiasf_ :
PLMD::ves::WellTemperedModifer
invBox :
PLMD::Pbc
inverse :
PLMD::adjmat::ClusterDistribution
invlambda :
PLMD::mapping::ZpathVessel
invr0 :
PLMD::SwitchingFunction
invr0_ :
PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
invr0_2 :
PLMD::SwitchingFunction
invReduced :
PLMD::Pbc
invsigma :
PLMD::bias::MetaD::Gaussian
,
PLMD::bias::PBMetaD::Gaussian
iov_base :
PLMD::molfile::fio_iovec
iov_len :
PLMD::molfile::fio_iovec
ipos :
PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift
iprecision :
PLMD::generic::DumpAtoms
IQ :
PLMD::Random
Iq0 :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_mix :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_mix_D :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_mix_H :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_solv :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_solv_H :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_vac :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_vac_D :
PLMD::isdb::SAXS
Iq0_vac_H :
PLMD::isdb::SAXS
IR :
PLMD::Random
ir_size :
PLMD::molfile::trx_hdr
,
PLMD::xdrfile::t_trnheader
is_active :
PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
is_file :
PLMD::TypesafePtr
is_floating_point :
PLMD::TypesafePtr
is_integral :
PLMD::TypesafePtr
isaction :
PLMD::Keywords
isatoms :
PLMD::Keywords
isChargeSet_ :
PLMD::vatom::Center
iscltool :
PLMD::function::FuncSumHills
isdens :
PLMD::crystallization::GradientVessel
isDerivative :
PLMD::lepton::Operation::Custom
iselect :
PLMD::isdb::MetainferenceBase
isEnergy :
PLMD::colvar::Colvar
,
PLMD::Colvar
,
PLMD::sasa::Colvar
isExtraCV :
PLMD::colvar::Colvar
,
PLMD::Colvar
,
PLMD::sasa::Colvar
isFirstStep :
PLMD::bias::MaxEnt
,
PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
,
PLMD::isdb::SAXS
,
PLMD::ves::Optimizer
isFirstStep_ :
PLMD::bias::MetaD
,
PLMD::bias::PBMetaD
,
PLMD::opes::OPESexpanded
,
PLMD::opes::OPESmetad< mode >
,
PLMD::ves::VesDeltaF
isInitialized :
PLMD::RMSDCoreData
isIntPower :
PLMD::lepton::Operation::PowerConstant
isMassSet_ :
PLMD::vatom::Center
isopen :
PLMD::function::FilesHandler
isReady_ :
PLMD::opes::ExpansionCVs
iswhole_ :
PLMD::GenericMolInfo
items :
PLMD::Citations
iter_counter :
PLMD::ves::Optimizer
iter_tol :
PLMD::dimred::SketchMapSmacof
iteration_and_time_active_ :
PLMD::ves::CoeffsBase
iteration_opt :
PLMD::ves::CoeffsBase
ITMAX :
PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
,
PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >
,
PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
iv :
PLMD::Random
iy :
PLMD::Random
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