Here is a list of all related symbols with links to the classes they belong to:

A

B

C

D

E

F

G

I

L

M

O

P

Q

R

S

T

V

- a -

• Action : PLMD::ActionOptions, PLMD::Keywords
• ActionAtomistic : PLMD::Atoms
• ActionRegister : PLMD::ActionOptions
• ActionShortcut : PLMD::Action
• ActionWithInputGrid : PLMD::gridtools::GridVessel
• ActionWithInputMatrix : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase, PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixVessel
• ActionWithInputVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• ActionWithValue : PLMD::Value
• ActionWithVessel : PLMD::vesselbase::Vessel
• ActionWithVirtualAtom : PLMD::Atoms
• AdaptivePath : PLMD::mapping::Mapping, PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
• add : PLMD::Value
• AdjacencyMatrixBase : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixVessel
• AdjacencyMatrixVessel : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• AtomValuePack : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• AveragingVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithAveraging

- b -

• BridgedMultiColvarFunction : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• BridgeVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel

- c -

• chol_elsolve : PLMD::Matrix< T >
• cholesky : PLMD::Matrix< T >
• CLTool : PLMD::CLToolOptions
• CLToolRegister : PLMD::CLToolOptions
• copy : PLMD::Value
• crossProduct : PLMD::VectorGeneric< n >

- d -

• dcrossDv1 : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• dcrossDv2 : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• delta : PLMD::VectorGeneric< n >
• deriNorm : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• determinant : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• diagMat : PLMD::Matrix< T >
• diagMatSym : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• Direction : PLMD::ReferenceArguments, PLMD::ReferenceAtoms
• distance : PLMD::ReferenceConfiguration
• dotProduct : PLMD::VectorGeneric< n >
• DumpGrid : PLMD::gridtools::ActionWithInputGrid, PLMD::gridtools::GridVessel

- e -

• extProduct : PLMD::TensorGeneric< n, m >

- f -

• FunctionVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel

- g -

• GradientVessel : PLMD::crystallization::Gradient

- i -

• inverse : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• Invert : PLMD::Matrix< T >

- l -

• LocalAverage : PLMD::multicolvar::AtomValuePack
• logdet : PLMD::Matrix< T >

- m -

• matmul : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• MatrixColumnSums : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• matrixOut : PLMD::Matrix< T >
• MatrixRowSums : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• MatrixSquareBracketsAccess : PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row, PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
• modulo : PLMD::VectorGeneric< n >
• modulo2 : PLMD::VectorGeneric< n >
• Moments : PLMD::vesselbase::StoreDataVessel
• mpi_gatherActiveMembers : PLMD::DynamicList< T >
• mult : PLMD::Matrix< T >
• MultiColvarBase : PLMD::multicolvar::AtomValuePack, PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction, PLMD::multicolvar::VolumeGradientBase
• MultiColvarFilter : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• MultiColvarFunction : PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction
• MultiDomainRMSD : PLMD::ReferenceAtoms, PLMD::ReferenceValuePack

- o -

• operator!= : PLMD::AtomNumber
• operator* : PLMD::Matrix< T >, PLMD::TensorGeneric< n, m >, PLMD::VectorGeneric< n >, PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• operator+ : PLMD::TensorGeneric< n, m >, PLMD::VectorGeneric< n >, PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• operator- : PLMD::TensorGeneric< n, m >, PLMD::VectorGeneric< n >, PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• operator/ : PLMD::TensorGeneric< n, m >, PLMD::VectorGeneric< n >
• operator< : PLMD::AtomNumber
• operator<< : PLMD::ActionRegister, PLMD::Citations, PLMD::CLToolRegister, PLMD::Matrix< T >, PLMD::OFile, PLMD::PDB, PLMD::Random, PLMD::Stopwatch, PLMD::Subprocess, PLMD::TensorGeneric< n, m >, PLMD::VectorGeneric< n >
• operator<= : PLMD::AtomNumber
• operator== : PLMD::AtomNumber
• operator> : PLMD::AtomNumber
• operator>= : PLMD::AtomNumber
• operator>> : PLMD::Random
• OptimalRMSD : PLMD::ReferenceValuePack
• OrderingVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• OrientationSphere : PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
• OutputPCAProjection : PLMD::dimred::PCA

- p -

• ParsedExpression : PLMD::lepton::CompiledExpression, PLMD::lepton::ExpressionProgram, PLMD::lepton::ExpressionTreeNode
• plumed_assert : PLMD::Exception
• plumed_dbg_assert : PLMD::Exception
• plumed_dbg_massert : PLMD::Exception
• plumed_error : PLMD::Exception
• plumed_error_nested : PLMD::Exception
• plumed_here : PLMD::Exception
• plumed_massert : PLMD::Exception
• plumed_merror : PLMD::Exception
• PLUMED_REGISTER_ACTION : PLMD::ActionRegister
• PLUMED_REGISTER_CLTOOL : PLMD::CLToolRegister
• product : PLMD::Value
• ProjectNonLandmarkPoints : PLMD::dimred::DimensionalityReductionBase
• PropertyMap : PLMD::mapping::Mapping
• pseudoInvert : PLMD::Matrix< T >

- q -

• quotient : PLMD::Value

- r -

• ReadAnalysisFrames : PLMD::analysis::DataCollectionObject
• ReadDissimilarityMatrix : PLMD::analysis::AnalysisBase
• ReferenceConfiguration : PLMD::ReferenceArguments, PLMD::ReferenceAtoms, PLMD::ReferenceConfigurationOptions
• ReselectLandmarks : PLMD::analysis::AnalysisBase, PLMD::analysis::LandmarkSelectionBase

- s -

• ShortcutVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• SingleDomainRMSD : PLMD::ReferenceAtoms, PLMD::ReferenceConfiguration
• SketchMapBase : PLMD::dimred::DimensionalityReductionBase
• Stopwatch : PLMD::Stopwatch::Handler, PLMD::Stopwatch::Watch
• StoreDataVessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• Subprocess : PLMD::Subprocess::Handler

- t -

• transpose : PLMD::Matrix< T >, PLMD::TensorGeneric< n, m >
• TrigonometricPathVessel : PLMD::mapping::Mapping

- v -

• VcrossTensor : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• Vessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel, PLMD::vesselbase::VesselOptions
• VolumeGradientBase : PLMD::crystallization::VectorMultiColvar, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase