Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

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X

Z

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~

- e -

• ECVcustom() : PLMD::opes::ECVcustom
• ECVlinear() : PLMD::opes::ECVlinear
• ECVmultiThermal() : PLMD::opes::ECVmultiThermal
• ECVmultiThermalBaric() : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
• ECVumbrellasFile() : PLMD::opes::ECVumbrellasFile
• ECVumbrellasLine() : PLMD::opes::ECVumbrellasLine
• EDS() : PLMD::eds::EDS
• EEFSolv() : PLMD::colvar::EEFSolv
• EffectiveEnergyDrift() : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• EMMI() : PLMD::isdb::EMMI
• empty() : PLMD::Citations
• emptyActiveMembers() : PLMD::DynamicList< T >, PLMD::MultiValue
• enable() : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• enableBiasFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enabled() : PLMD::LinkCells
• enableDynamicTargetDistFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enableDynamicTargetDistribution() : PLMD::ves::VesBias
• enableFesFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enableFesProjFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enableHessian() : PLMD::ves::Optimizer, PLMD::ves::VesBias
• enableIterationNumberInFilenames() : PLMD::ves::VesBias
• enableMultipleCoeffsSets() : PLMD::ves::VesBias
• enableNestedExceptions() : PLMD::PlumedMain
• enableStaticTargetDistFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• EndPlumed() : PLMD::generic::EndPlumed
• Energy() : PLMD::colvar::Energy
• enforceBackup() : PLMD::OFile
• enforceRestart() : PLMD::OFile
• enforceSuffix() : PLMD::FileBase
• Ensemble() : PLMD::function::Ensemble
• EnvironmentSimilarity() : PLMD::crystallization::EnvironmentSimilarity
• eraseFile() : PLMD::PlumedMain
• Erf() : PLMD::lepton::Operation::Erf
• Erfc() : PLMD::lepton::Operation::Erfc
• ERMSD() : PLMD::colvar::ERMSD, PLMD::ERMSD
• error() : PLMD::Action, PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool, PLMD::DLLoader, PLMD::ReferenceConfiguration, PLMD::vesselbase::Vessel
• estimateNumSteps() : PLMD::opes::ExpansionCVs
• EuclideanDissimilarityMatrix() : PLMD::analysis::EuclideanDissimilarityMatrix
• EuclideanDistance() : PLMD::EuclideanDistance
• evaluate() : PLMD::KernelFunctions, PLMD::lepton::CompiledExpression, PLMD::lepton::CustomFunction, PLMD::lepton::ExpressionProgram, PLMD::lepton::Operation::Abs, PLMD::lepton::Operation::Acos, PLMD::lepton::Operation::Add, PLMD::lepton::Operation::AddConstant, PLMD::lepton::Operation::Asin, PLMD::lepton::Operation::Atan2, PLMD::lepton::Operation::Atan, PLMD::lepton::Operation::Ceil, PLMD::lepton::Operation::Constant, PLMD::lepton::Operation::Cos, PLMD::lepton::Operation::Cosh, PLMD::lepton::Operation::Cot, PLMD::lepton::Operation::Csc, PLMD::lepton::Operation::Cube, PLMD::lepton::Operation::Custom, PLMD::lepton::Operation::Delta, PLMD::lepton::Operation::Divide, PLMD::lepton::Operation::Erf, PLMD::lepton::Operation::Erfc, PLMD::lepton::Operation, PLMD::lepton::Operation::Exp, PLMD::lepton::Operation::Floor, PLMD::lepton::Operation::Log, PLMD::lepton::Operation::Max, PLMD::lepton::Operation::Min, PLMD::lepton::Operation::Multiply, PLMD::lepton::Operation::MultiplyConstant, PLMD::lepton::Operation::Nandelta, PLMD::lepton::Operation::Negate, PLMD::lepton::Operation::Power, PLMD::lepton::Operation::PowerConstant, PLMD::lepton::Operation::Reciprocal, PLMD::lepton::Operation::Sec, PLMD::lepton::Operation::Select, PLMD::lepton::Operation::Sin, PLMD::lepton::Operation::Sinh, PLMD::lepton::Operation::Sqrt, PLMD::lepton::Operation::Square, PLMD::lepton::Operation::Step, PLMD::lepton::Operation::Subtract, PLMD::lepton::Operation::Tan, PLMD::lepton::Operation::Tanh, PLMD::lepton::Operation::Variable, PLMD::lepton::ParsedExpression, PLMD::lepton::PlaceholderFunction, PLMD::pamm::HBPammObject, PLMD::pamm::PammObject
• evaluateDerivative() : PLMD::lepton::CustomFunction, PLMD::lepton::PlaceholderFunction
• evaluateGaussian() : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• evaluateGaussianAndDerivatives() : PLMD::bias::MetaD
• evaluateKernel() : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• evaluateNumericalDerivatives() : PLMD::cltools::Driver< real >
• Exception() : PLMD::Exception, PLMD::ExceptionDebug, PLMD::ExceptionError, PLMD::ExceptionTypeError, PLMD::lepton::Exception
• ExchangePatterns() : PLMD::ExchangePatterns
• exists() : PLMD::ActionWithValue, PLMD::Keywords
• exit() : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
• Exp() : PLMD::lepton::Operation::Exp
• expandArgKeywordInPDB() : PLMD::ActionWithArguments
• ExpansionCVs() : PLMD::opes::ExpansionCVs
• explore() : PLMD::adjmat::DFSClustering, PLMD::adjmat::OutputCluster
• explore_dfs() : PLMD::adjmat::OutputCluster
• ExponentiallyModifiedGaussianDiagonal() : PLMD::ves::TD_ExponentiallyModifiedGaussian
• ExponentialPowerDiagonal() : PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal
• ExpressionProgram() : PLMD::lepton::ExpressionProgram
• ExpressionTreeNode() : PLMD::lepton::ExpressionTreeNode
• ExtendedLagrangian() : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
• extension() : PLMD::Tools
• External() : PLMD::bias::External
• extra_msg() : PLMD::TypesafePtr
• extractArgumentDisplacement() : PLMD::Direction, PLMD::ReferenceArguments
• extractAtomicDisplacement() : PLMD::Direction, PLMD::MultiDomainRMSD, PLMD::OptimalRMSD, PLMD::ReferenceAtoms, PLMD::SimpleRMSD
• extractDisplacementVector() : PLMD::ReferenceConfiguration
• ExtraCV() : PLMD::colvar::ExtraCV